综合管理部：负责党群、行政管理、人力资源管理、物资与设施管理、安全与保密管理、后勤保障、对外公共关系管理、信息发布管理、工会和企业文化建设、日常事务管理等工作；协助单位领导组织日常办公及有关活动安排；组织制定并完善相关规章制度和业务流程，协调、优化各部门工作关系，确保佛山产研院高效运行。
财务资产部：负责财务管理、资产管理、会计核算、预算管理、信息化系统管理；贯彻执行国家的财税政策和会计准则，建立健全财务规章制度；通过信息系统梳理业务流程，监督防范财务风险；开展股权资产评估，办理投资平台及股权转让涉税事项；办理孵化投资企业银行委托贷款；负责控股企业及境外孵化器的财务监督及稽核。
战略风控部：负责研究国家产业政策、产业发展方向，前沿性、颠覆性技术研究论证，产业发展动态研究，为战略决策提供咨询与建议；负责科技创新信息服务和专题培训；负责构建全面风险管理体系,制订和修订风险管理规章制度，定期出具战略、投资和孵化风控意见和评价；负责孵化与加速载体的规划与拓展；博士后工作站管理。
资本运营部：构建省科学院特色的投资孵化体系；负责资本运营工作相关制度的建立与修订；负责拟投资孵化项目收集、入库立项、尽职调查、投资谈判、落地实施；负责产研院创新创业团队资助资金的使用及管理；按照省科学院技术育成孵化工作要求，为参控股企业提供投后管理与服务；探索天使资本池合作模式，引导社会资本投向科技型初创企业。
研发孵化部：构建省科学院特色的技术育成孵化体系；负责众创空间、孵化器和加速器等孵化载体的统筹管理；负责新型研发机构及技术研发中心建设；负责各类科技企业及创新团队的引进和管理；负责各类政府项目、资质申报和科技服务等工作的组织协调及管理；负责科创活动的组织和管理；负责对孵化企业开展企业服务及相关培训；负责中白产业技术联合创新中心有限公司的统筹、协调。
广科人才公司：打造佛山产研院专业科技服务板块。主要负责技术评价与转移服务；负责各类型科技企业项目申报服务；负责产学研合作服务以及科技企业工商财税服务；负责科技企业与人才评价服务；负责技术经纪人职称培训；负责粤科智创众创空间及加速载体的运营管理。
